Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms