Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Capn13Q3UW68 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn13Q3UW68 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms