Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm29609Q3UU56 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms