Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Skap2Q3UND0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms