Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UJP5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms