Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms