Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms