Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms