Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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