Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U595 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U595 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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