Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms