Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms