Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Plekhf1Q3TB82 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Plekhf1Q3TB82 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms