Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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