Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpusd3Q14AI6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms