Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spatc1Q148B6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms