Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp2b3Q0VF55 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms