Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Shisal1Q0VBP7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisal1Q0VBP7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms