Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb8Q0VBD0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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