Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntnap5cQ0V8T7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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