Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms