Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NeblQ0II04 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms