Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttc21bQ0HA38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms