Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CbfbQ08024 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms