Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms