Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gdf3Q07104 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms