Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms