Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms