Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms