Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col6a2Q02788 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms