Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd1Q01822 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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