Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms