Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Serpina1cQ00896 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms