Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms