Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms