Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brca2P97929 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms