Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gfra1P97785 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms