Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tarbp2P97473 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms