Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmsP97355 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmsP97355 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SmsP97355 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmsP97355 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmsP97355 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmsP97355 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SmsP97355 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms