Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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