Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nucb2P81117 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nucb2P81117 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms