Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Otx1P80205 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms