Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms