Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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