Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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