Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbdsP70122 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms