Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms