Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms