Protein–RNA interactions for Protein: P63005

Pafah1b1, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b1P63005 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b1P63005 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms