Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tra2bP62996 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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